La cassitérite est le minéral typique des gisements pneumatolytiques, on qualifie de pneumatolytique, un gîte métallifère lorsque l'on juge que le transport et la mise en place des matériaux qui le composent se sont effectués à l'état de vapeur.

Elle est associée aux greisens, des roches micacées présentes à la bordure des massifs granitiques ou des filons granitiques et issus du remplacement des feldspaths présents dans ces formations, par l'association quartz-muscovite sous l'action de fluides pneumatolytiques (vapeur d'eau, fluor, bore, chlore, etc ...). Les greisens peuvent, parfois, constituer des gisements de cassitérite, fluorite, tourmaline, béryl, et aux filons de quartz de haute température avec la ferbérite,  l'arsénopyrite, la molybdénite, etc.  

Parfois présente dans certaines pegmatites aussi dans des skarns. Sa grande dureté la rend présente dans les gisements secondaires détritiques alluvionnaires. C'est le minerai d’étain. Les cristaux sont fréquents et souvent bien définis et brillants. La variété « étain de bois » est aussi une cassitérite holomorphe à structure fibroradié parfois globulaire pouvant former des cocardes ( Cornouaille, Angleterre ).

Les minéraux qui accompagnent la cassitérite sont nombreux, albite, apatite, arsénopyrite, béryl, fluorite, molybdénite, quartz, scheelite, topaze, tourmaline, wolframite, etc.

Ce sont principalement des impuretés d’oxydes de fer (Fe) qui colorent la cassitérite, qui est incolore en absence d’impuretés ce qui est extrêmement rare.